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蛋白質(zhì)分子的序列是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的基礎。準確測定蛋白質(zhì)序列在在研究蛋白功能表位，檢測商業(yè)單克隆抗體，疫苗，以及試劑盒等藥物方面有著(zhù)很重要的作用。目前已有很多對蛋白測序的研究，目前對蛋白質(zhì)精準測序還是不能夠像DNA一樣快速精準。蛋白測序主要受制于蛋白樣品純化，構成蛋白的氨基酸組成種類(lèi)眾多等復雜因素影響。

這期給大家科普的技術(shù)叫做蛋白質(zhì)從頭測序（De novo se），又叫全新蛋白測序，這項技術(shù)是根據肽段與惰性氣體相碰撞產(chǎn)生的一系列的有規律的片段離子之間的質(zhì)量差來(lái)推斷氨基酸序列。我們可以根據肽鍵斷裂處的y離子和b離子來(lái)推測氨基酸序列，以及翻譯后修飾。De novo se有一項突出的優(yōu)勢，是傳統質(zhì)譜測序不能達到的，那就是不依賴(lài)任何蛋白質(zhì)數據庫，對未知蛋白質(zhì)從頭測序。

在傳統測序中，往往只能檢測蛋白消化后的部分肽段序列，再用這些肽段序列與已知的蛋白數據庫進(jìn)行比對，根據一定算法打分，推算出可能性高的蛋白和序列。

傳統的測序的局限有：

1-. 質(zhì)譜測序依賴(lài)于公共數據庫。 如果所研究的物種的基因組沒(méi)有完全被測序，或者其中部分沒(méi)有對應的序列， 那么質(zhì)譜測序將無(wú)法得出正確的鑒定。

2. 使用的搜索引擎的打分和算法可能也會(huì )遺漏一部分的肽段和質(zhì)譜圖的匹配， 產(chǎn)生假陽(yáng)性結果。

3. 如果有點(diǎn)突變或者未知修飾存在的話(huà)， 由于搜庫算法或者參數設置中沒(méi)有考慮到， 同樣也無(wú)法得出正確的結果。

這些傳統質(zhì)譜測序的局限都可能在De novo se中被突破，選用De novo se可以提供傳統測序至今無(wú)法準確評估的服務(wù)，包括：蛋白質(zhì)突變分析、全新蛋白／肽段從頭測序、單克隆抗體從頭測序等。

De novo se鑒定流程和具體特點(diǎn)

蛋白質(zhì)從頭測序分析流程

服務(wù)項目

從頭測序分析服務(wù)項目

服務(wù)優(yōu)勢

? 采用高精準度質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos

? 全長(cháng)測序覆蓋率高達1_0_0_%

? 首位氨基酸測序準確率高達95%

? 樣品用量低：蛋白樣品僅需100ug，即可完成檢測

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