在實際貿易中，會存在很多的情況：1、有很多半成品供應商銷售產品給成品生產商時遇到困難。成品生產商是加貿企業(yè)，而供應商是一般企業(yè)。成品生產商要求做轉廠，供應商無法轉廠；2、加貿企業(yè)的兩家工廠，由于歸屬的主管海關不同，手冊備案信息差異等問題，都可能導致無法轉廠；
此時，通過保稅區(qū)，可以實現“轉廠”操作，達成貿易交貨。

保稅區(qū)轉廠就是通過保稅區(qū)入區(qū)退稅政策，以先出口再進口的方式解決加工貿易企業(yè)深加工結轉手續(xù)復雜，深加工增值部分不予退稅問題；通過賣方先把貨物出口到保稅區(qū)，買方再從保稅區(qū)報關進口的過程，加工貿易企業(yè)用手冊報關進口以達到免稅進口的目的。

轉廠都是跟加工貿易企業(yè)（外資企業(yè)）有關的。因為加工貿易企業(yè)屬于海關監(jiān)管企業(yè)，使用手冊報關，原材料需要進口的，生產的產品也需要出口，這樣才能核銷手冊。加工貿易企業(yè)在國內采購原材料的時候需要原材料供應商把貨物出口到保稅區(qū)，加工貿易企業(yè)再用手冊報關進口以達到免稅進口的目的；或者加工貿易企業(yè)生產的產品需要在國內銷售，就必須先通過出口完成手冊出口核銷，再由買方申報進口，如果不這樣操作的話加工貿易企業(yè)需要補證原材料進口的關稅和其它稅費